RAD značky jsou sekvence DNA, které bezprostředně hraničí s každou instancí určitého restrikčního místa po celém genomu. RAD značky mohou být použity jako marker pravděpodobných SSR/AFLP. RAD značky mohou být analyzovány pro identifikaci anebo genotypizaci polymorfismů DNA sekvence, jako jsou například jedno-nukleotidové polymorfismy (SNP). Při použití této metody, můžete snížit komplexitu genomu a i bez referenčního genomu může tato technologie rychle identifikovat místa SNP, a tak genetická mapa s vysokou hustotou může být sestavena, tato mapa může být použita pro QTL mapování.
