Analýza specifických vláken transkriptomu může určit, z kterého vlákna transkript pochází, a může určit hranice transkriptu. Je možné spočítat přesněji množství transkriptů. Nekódující RNA může být také zkoumána. Analýza představuje důležitý přístup pro studium jemné genové struktury a regulace genové exprese.
| Stav vzorku | Integrovaná celková RNA, která byla ošetřena DNázou. Vyhněte se kontaminaci proteiny při izolaci RNA. |
| Množství vzorku | Pro konstrukci 1 knihovny - celková RNA ≥ 5μg |
| Koncentrace vzorku | ≥65ng/ul |
| Čistota vzorku | OD260/280≥1,8; OD260/230≥1,8; Agilent 2100 výsledky: RNA 23S:16S≥1, RIN ≥ 6,0 a baseline by měla být hladká |
| Strategie konstrukce knihovny | Knihovna krátkých insertů: 100-500 bp krátké inserty |
| Sekvenční strategie | 91PE Sekvenování |
| Obsah bioinformatické analýzy | Standardní bioinformatická analýza (referenční geny, genomová sekvence a genová anotace by měly být poskytnuty)
Bioinformatická analýza na zakázku Můžeme také provést analýzu na zakázku pro splnění požadavků konkrétních projektů. |
| Ukazatel dokončení | Čistá výstupní data by neměla být menší, než je požadováno ve smlouvě. |
| Doba zpracování | Standardní doba odezvy pro tento postup (viz výše) je 50 pracovních dní. |
