Celogenomové sekvenování lidského genomu (hWGS) umožňuje vědcům katalogizovat genetickou konstituci jednotlivců a zachytit všechny varianty (jedno-nukleotidové varianty -SNV, inzerce a delece - InDels, varianty počtu kopií - CNV a velké strukturální varianty - SV) přítomné v jednom testu.
Celogenomové sekvenování (WGS) poskytuje nejkomplexnější soubor genetických variant u jedinců stejného druhu nebo mezi příbuznými druhy. Informace o variantách (SNP, InDel, CNV, SV) získané prostřednictvím WGS se používají v populační genetice a celogenomových asociačních studiích (GWAS) pro studium příčin nemocí, výběr rostlin a zvířat pro zemědělské šlechtitelské programy a identifikaci běžných genetických variant mezi populacemi.
Celogenomové re-sekvenování bakteriálních a houbových genomů je zásadním nástrojem pro získání kompletních genomů známých bakterií a hub, stejně jako pro porovnání více genomů nebo k mapování genomů nových organismů. Je velmi důležité sekvenovat celé genomy bakterií a hub za účelem vytvoření přesných referenčních genomů, dále provést identifikaci mikrobů a další srovnávací studie genomů.
