Při jakékoliv infekci vzniká vztah mezi infekčním agens a hostitelským agens. Jedná o proces, který má mnoho podob, klinických a laboratorních příznaků a probíhá v několika fázích a dospívá k různým výsledkům. Z hlediska člověka jako hostitele (nakaženého) jde vlastně o rekci na zásah vnějšího prostředí, na který je jeho organizmus připraven řadou obranných mechanizmů.
Tyto mechanizmy se vytvořily během vývoje. Jde především o imunitní reakci, která má dvě podoby: buněčnou a protilátkovou. Buněčná imunita se projevuje cytotoxickou reakcí na buňky pozměněné přítomností infekčního agens. V případě protilátkové imunity se vytváří bílkoviny — protilátky proti bílkovinám infekčního agens, které blokují jeho účinek.