Upravit stránku

Metagenomika

Metagenomika je studium genetického materiálu, který je získaný přímo ze životního prostředí. Tradiční mikrobiologie a genomika se spoléhá na kultivované klonální kultury. Častým sekvenováním genů z těchto vzorků došlo k tomu, že drtivá většina z nich nyní postrádá biologickou rozmanitost. A tato rozmanitost je v rámci pochopení živého světa velice důležitá. Metagenomika je účinným nástrojem pro sledování této rozmanitosti v rámci mikrobiálního světa. 

Aplikace metagenomiky a výzkum mikrobiomu zahrnují:

  • Sekvenace mikroorganismů z půdních vzorků zdravých a nezdravých plodin k identifikaci možných bakterií a druhů Archea. Tím je možné zvolit vhodné ošetření půdy ke zlepšení zdraví plodin.
  • Zkoumání složitých interakcí mikrobiálních komunit ve zdravých a nezdravých ekosystémech. A následně lepší porozumění populace a složení mikrobiomu a jak ovlivňuje celkové zdraví a funkci životního prostředí.
  • Zkoumání střevních a jiných mikrobiomů, protože se týkají chorobných stavů, jako je cukrovka, Alzheimerova choroba a bakteriální infekce. Složení těchto mikrobiálních komunit může být zkoumáno před a po léčbě léky nebo terapeutickými přípravky. Tím dojde k průzkumu účinků léčby na cíl a mimo cíl, což poskytne přehled o přínosu léčby pro pacienta.
     

A jakými způsoby můžeme metogenomiku studovat?

Sangerovo sekvenování genu 16S rRNA 

Sangerovo sekvenování genů 16S rRNA identifikuje klonální a izolované bakteriální nebo archeálních kolonie. Tato služba zahrnuje PCR plus Sangerovo sekvenování a je ideální pro situace, které vyžadují hloubkovou analýzu jednotlivých izolovaných vzorků spíše než analýzu složení komunity.

Analýza metagenomu

Metagenomika může využít sekvenování nové generace k rychlé analýze rozmanitosti mikrobiálních společenstev a objasnění role jednotlivých druhů. Nabízíme sadu metagenomických analýz od cílených testů (16S pro prokaryoty a ITS2 pro houby) až po analýzu celého genomu.

Celogenomové sekvenování 

Komplexní celogenomové sekvenování umožňuje zkoumání celých genomů bakterií nebo zajímavých archeí. Tato služba poskytuje podrobnosti o genomech všech identifikovaných organismů, které jsou předmětem výzkumu. Dále nachází environmentálně nebo etiologicky relevantní mutace nebo rozsáhlé modifikace genomu. Celogenomové sekvenování zahrnuje také vysoce výkonný přístup s krátkým čtením a novější přístup s dlouhým čtením pro vysoce repetitivní nebo složité genomy.

Máte-li o metagenomiku zájem, neváhejte nám napsat

  • Položky označené hvězdičkou (*) jsou povinné.
Nahoru

Tento web využívá cookies

Pro chod webu jsou nezbytně aktivovány esenciální soubory cookies. Pro plnohodnotné poskytování služeb, personalizaci reklam a analýzu návštěvnosti jsou však nutné povolit i volitelné cookies. Kliknutím na následující tlačítko, je zapnete. Zobrazit podrobnosti

Odmítnout vše Nastavení Povolit vše

Nastavení cookies

Vaše soukromí je důležité. Můžete si vybrat z nastavení cookies níže. Zobrazit podrobnosti

Potvrdit vše Potvrdit moje volby