-
Mikrobiom je soubor mikrobů (bakterie, kvasinky, viry), které s námi žijí a ovlivňují trávení i imunitu.
-
Probiotika nejsou univerzální léčba. Nejlépe fungují při/po antibiotikách, když se zvolí ověřené kmeny a začne se včas.
-
Mimo antibiotika u zdravých lidí obvykle stačí pestrá strava, vláknina a fermentované potraviny.
-
Analýzu mikrobiomu děláme 16S/ITS/18S, shotgun metagenomikou i long-read integrací; výsledky dodáme s jasným reportem a doporučeními „co dělat dál“.
-
Umíme škálovat a integrovat data přes GENEWIZ (Azenta), HaploX, Edinburgh Genomics/Genetics a automatizaci xTrovert.
Co je mikrobiom
Mikrobiom je „ekosystém“ mikroorganismů v našem těle. Ve střevech pomáhá trávit složky potravy, vyrábí metabolity a komunikuje s imunitou. Složení mikrobiomu ovlivňuje hlavně strava, léky (např. antibiotika) a životní styl.
Probiotika – kdy ano
-
Při/po antibiotikách – cílem je snížit riziko průjmu. Nejlepší data mají např. Saccharomyces boulardii (kvasinka; lze brát i současně s ATB) a Lactobacillus rhamnosus GG; případně multikmenové směsi (Lactobacillus + Bifidobacterium) ve vysoké denní dávce. Začít ideálně do 48 h od první dávky ATB a pokračovat 1–2 týdny po dobrání.
-
Doplněk k eradikaci Helicobacter pylori – může zlepšit snášenlivost léčby.
-
Pouchitida po operaci s „váčkem“ (IPAA) – vybrané multikmenové směsi v péči gastroenterologa.
-
Velmi nedonošení novorozenci – jen nemocniční protokoly.
Probiotika – kdy spíše ne
-
Rutinně u dráždivého tračníku, většiny zánětlivých střevních nemocí, „obecné imunity“ či akutních dětských průjmů – přínos je nejistý.
-
Lupénka a alergie – pouze jako doplněk ke standardní léčbě; efekt bývá malý/nejistý a nenahrazuje terapii.
-
Bez lékaře ne: oslabená imunita, kriticky nemocní, centrální žilní katétr, umělá chlopeň; těžké akutní střevní stavy.
Co má smysl pro každodenní život
-
Pestrá strava s dostatkem vlákniny (luštěniny, celozrnné obiloviny, ovoce, zelenina).
-
Fermentované potraviny (jogurt, kefír, kysané zelí/kimchi).
-
Spánek, pohyb, zvládání stresu.
-
Pokud doplněk: zkouška 8–12 týdnů, pokračovat jen při reálném přínosu.
Naše analýzy mikrobiomu (RUO/výzkum)
Co nabízíme:
-
16S/ITS/18S amplicon (rychlá kompozice bakterií/kvasinek/protozoí)
-
Shotgun metagenomika (druhy/kmeny + funkce, ARG, virom)
-
Long-read integrace (PacBio/ONT) přes partnery pro assembly, plazmidy, mobilom
-
Volitelně metatranskriptomika (aktivní genová exprese mikrobů)
Bioinformatika a výstupy:
-
Pipeline (např. QIIME2/MetaPhlAn/HUMAnN), QC report, taxonomie (gráfy), funkční profily, základní doporučení k intervencím (strava, fermenty, opatrně s tvrzeními).
-
Dodáme .fastq, report (PDF/HTML), tabulky CSV/JSON.
-
Reprodukovatelnost: verze pipeline + parametry v reportu.
Logistika & kvalita:
-
Odběrové sady se stabilizátorem, návod, sledování teploty (pokud je vyžadováno).
-
Kontroly (negativ/pozitiv), spike-in dle potřeby studie.
-
TAT dle kapacity a zvoleného panelu.
Partneři & škálování:
-
GENEWIZ (Azenta) – standardizované 16S/ITS/shotgun běhy (globální kapacita).
-
HaploX – 16S/18S/ITS v rámci multi-omics.
-
Edinburgh Genomics/Genetics – PacBio/ONT pro long-read a náročné metagenomické projekty.
-
Automatizace xTrovert – příprava knihoven, izolace, robustní výtěžky (např. plazmidy i mikrobiom).
Pro koho:
-
Výzkumné skupiny, biotechnologické a potravinářské firmy, projekty výživy, R&D piloty
Jak spolupráce probíhá (6 kroků)
-
Konzultace cíle (vědecké/produktové otázky, matice vzorků).
-
Návrh panelu (16S vs. shotgun, hloubka čtení, počet vzorků, QC).
-
Odběr & logistika (sady, štítkování, stabilizace).
-
Laboratoř & sekvenace (in-house + partneři).
-
Analýza & report (taxonomie, funkce, srozumitelné závěry).
-
Follow-up (interpretace, doporučení, případně opakované měření/longitudinální design).
FAQ (krátce)
Kdy vzorek po antibiotikách? Ideálně 2–4 týdny po dobrání, pokud cílem není sledovat akutní změny.
Můžu měnit stravu před odběrem? Raději ne – udrž stejné návyky min. 3–7 dní, ať zachytíme „stav reality“.
Dostanu konkrétní jídelníček? Ano, praktický rámec – zvýšení fermentovaných potravin a vlákniny, s ohledem na toleranci.
Děláte klinická doporučení? Poskytujeme výzkumné reporty (RUO). Klinické intervence jsou na ošetřujícím lékaři.
Zacházení s daty? GDPR-compliant, možnost anonymizace a smluvních NDA.
Jak můžeme pomoci hned teď
-
Výzkumný pilot (střevo/kůže/potraviny/prostředí) – navrhneme panel a pošleme ukázkový report.
-
Firemní projekt – standardizované 16S/ITS/shotgun s jasným SLA, QC a jednotným reportingem.
-
Obsah pro váš web/edukaci – taháky „Probiotika kdy ano/kdy ne“, FAQ, checklist pro klienty.
Poznámka k regulaci: Probiotika jsou doplňky stravy, nikoli léčivé přípravky. Neprezentujeme je jako léčbu. U rizikových stavů rozhoduje lékař.