Upravit stránku

Low-pass celogenomové sekvenování

Low-pass celogenomové sekvenování překonává genotypizační arrays ve statistické síle a umožňuje objevovat nové varianty za stejné nebo nižší náklady.

Týmy BGI a Gencove se spojily, aby nabídly nejsilnější a finančně efektivní řešení pro objevování genomů dostupné na současném trhu. Použitím osvědčené technologie BGI DNBseq a Gencove's ImputeSeq imputačního postupu pro analýzu dat z low-pass sekvenování, poskytujeme výkonné a finančně efektivní řešení pro celogenomové asociační studie, populační genomiku, farmakogenomiku a další aplikace.

Přináší více za méně

Naše řešení pro low-pass sekvenování poskytuje řádově více dat a vyšší imputaci kvality než genotypizační arrays. Bez zjišťování šumu je to optimální technologie pro použití napříč populacemi a lze ji použít k vytvoření referenční panelu specifického pro danou populaci nebo nemoc.

BGI DNBseq v kombinaci s ImputeSeq společnosti Gencove Vám umožní efektivně získat plně imputované soubory VCF připravené k analýze vašich vzorků.

 

Síla low-pass celogenomového sekvenování

Low-pass WGS zvyšuje statistickou sílu ve srovnání s genotypizačními arrays a je výrazně méně zaujaté vůči evropským populacím. To znamená zvýšenou sílu pro pevný rozpočet a žádné přizpůsobení pro neevropské populace. Vysoce přesné Gencove ImputeSeq calling variant v celém genomu s průměrnou imputační shodou s hlubokým WGS 99% pro 1x pokrytí a 99,5% pro 4x. Přesnost imputace napříč všemi alelickými frekvencemi je ve srovnání s low-pass sekvenováním vyšší než u běžně používaných genotypizačních arrays.

 

Přesnost imputace z low-pass celogenomového sekvenování a dvou běžně používaných genotypizačních arrays.

Klíčové indikátory výkonu

 

 

Důvěra v práci s odborníky

Od vzorku až po soubory VCF připravené k analýze

Sekvenování světově nejzkušenějšími sekvenačními laboratořemi a imputační analýza dat předními výpočetními odborníky z oblasti genomiky.

Pro každý vzorek Vám ImputeSeq vrátí soubor BAM se všemi sekvenačními čtení, soubor VCF s vysoce kvalitními imputovanými calls variant pro všechny varianty v 1000 Genome Phase 3, jakož i analýzu předků a mikrobionů.

Nahoru