Základním rozdílem mezi Sangerovým sekvenováním a sekvenováním příští generace (NGS) je objem sekvenování.
- Sangerova metoda sekvenuje pouze jeden fragment DNA v čase a zaměřuje se pouze na konkrétní gen (nebo několik genů) nebo variantu.
- NGS, sekvenace nové generace, je masivně paralelní a sekvenuje miliony fragmentů současně v rámci jednoho běhu. Tento proces umožňuje sekvenování stovek až tisíců genů najednou. NGS také nabízí větší možnost objevovat nové nebo vzácné varianty pomocí hlubokého sekvenování.
