Koronavirus je RNA virus. Laboratoře zabývající se vyšetřováním/detekcí koronavirusu mohou ve svých metodických postupech využít následující kity:
- Izolace RNA z klinických vzorků
MagBio HighPrep™ Viral DNA/RNA Kit – kit založený na magnetických kuličkách pro rychlou izolaci celkových virových nukleových kyselin z plné krve, séra, plazmy, slin a dalších tělesných tekutin
https://www.magbiogenomics.com/highpreptm-viral-dna-rna-kit.html
Tento kit může být snadno automatizován na všech přístrojích umožňujících magnetickou izolaci.
- Detekce koronavirusu se provádí pomocí RT-PCR se specifickými primery nebo RT-qPCR se specifickými sondami jako jsou Taqman sondy. Tyto metody jako templát vyžadují cDNA (kity pro syntézu cDNA) nebo lze použít one step RT-PCR kit.
https://www.highqu.com/products/rt-pcr-rt-qpcr/reverse-transcription-rt-pcr.html
Produkt |
||||
Krátký popis |
One-step RT PCR |
cDNA syntéza dlouhých transkriptů při zvýšené teplotě |
Syntéza cDNA pro qPCR bez šumu |
Ochrana RNA během cDNA syntézy |
Zesílená cDNA syntéza |
● |
● |
● |
● |
GC-bohaté a komplexní templáty |
● |
● |
● |
● |
Transkripty cDNA plné délky, až do 15 kb |
|
● |
|
● |
Vysoká citlivost |
● |
● |
● |
● |
One-step RT-PCR |
● |
|
|
● |
Two-step RT-PCR |
|
● |
● |
● |
Two-step RT-qPCR |
|
● |
● |
● |
Ochrana RNA před RNázami |
● |
● |
● |
● |
highQu produkty: www.highQu.com
- 1Step RT PCR Kit (one step RT-PCR)
- HighScriber™ Reverse Transcriptase Mix, 20X (cDNA syntéza pro přípravu templátu pro PCR)
- qScriber™ cDNA Synthesis Kit (cDNA syntéza pro qPCR)
3. Poté je možné provést qPCR pomocí kitů qPCR, obvykle lidé pracují se specifickými sondami, takže nabízíme kity se sondami (ale možná někdo preferuje pracovat s interkalačními barvivy, pak nabízíme ORA qPCR Green Mixes).
- ORA™ qPCR Probe Mix, 2X
- ORA™ qPCR Probe ROX L Mix, 2X
- ORA™ qPCR Probe ROX H Mix, 2X
4. V některých případech lze použít one step RT-qPCR kity (přeskočí se kroky 2 a 3), kdy lze provést qPCR přímo z RNA vzorků z kroku 1.
- 1Step RT qPCR Probe Kit
- 1Step RT qPCR Probe ROX L Kit
- 1Step RT qPCR Probe ROX H Kit
Podívejte na video o koronavirusu: