Tento přehled se zaměřuje na sekvenování nové generace (NGS) a poskytuje ucelený pohled na hlavní výrobce a jejich technologie. Zároveň připravuji přehled NGS služeb, který bude sloužit jako vodítko pro zákazníky, kteří se snaží zorientovat v této dynamicky se rozvíjející oblasti.
🔬 Hlavní výrobci NGS přístrojů:
Illumina - Modely jako MiSeq, NextSeq, HiSeq a NovaSeq jsou známé svou vysokou přesností a širokým rozsahem aplikací. 💰💨
Thermo Fisher Scientific (Ion Torrent) - Ion PGM a Ion Proton nabízejí rychlé sekvenování s nižšími náklady na bázi. ⚡️💵
Pacific Biosciences (PacBio) - Sequel a RS II poskytují dlouhá čtení s vysokou přesností, ideální pro komplexní genomové analýzy. 📏🔍
Oxford Nanopore Technologies - MinION, GridION a PromethION umožňují flexibilní a přenosné sekvenování s možností dlouhých čtení. 🚀🧬
BGI/MGI - BGISEQ-500 a MGISEQ-2000 nabízejí cenově dostupné sekvenování s vysokou propustností. 💹📈
Roche 454 - Historické modely jako GS Junior a GS FLX, známé pro svou spolehlivost. 🏛️🔬
Qiagen GeneReader - Zaměřený na klinické aplikace s důrazem na přesnost a spolehlivost. 🏥🔍
Complete Genomics - Poskytuje služby celogenomového sekvenování s důrazem na detailní analýzu. 🌐🔬
Berry Genomics - Specializuje se na klinické aplikace s vysokou přesností. 🩺🔬
CapitalBio Technology - Nabízí různé genomické technologie pro široké spektrum aplikací. 🌟🔬
GenapSys - Vyvíjí kompaktní a cenově dostupné sekvenátory pro menší laboratoře. 🧪💡
Element Biosciences - Zaměřuje se na inovativní přístupy k sekvenování s důrazem na efektivitu. 🚀🔬
GenoCare - Menší výrobce s vlastními sekvenačními technologiemi, zaměřený na personalizovanou medicínu. 🧬❤️
Stratos Genomics - Pracuje na vývoji nové generace sekvenačních technologií s důrazem na rychlost. ⚡️🔬
Roswell Biotechnologies - Zaměřuje se na vývoj pokročilých sekvenačních platforem pro budoucnost. 🔮🔬
Ultima Genomics - Nová společnost s cílem snížit náklady na sekvenování a zvýšit dostupnost. 💰🔬
Singular Genomics - Vyvíjí nové technologie pro rychlé a přesné sekvenování s důrazem na inovaci. 🌟🔬
🆕 Další inovativní hráči:
Dovetail Genomics - Zlepšuje přesnost a kvalitu sekvenování pomocí pokročilých technologií. 🎯🔬
10x Genomics - Známý pro prostorové genomické analýzy a single-cell sekvenování. 🧬🔍
Stilla Technologies - Vyvíjí technologie pro digitální PCR a sekvenování s vysokou přesností. 📊🔬
Centrillion Technologies - Pracuje na pokročilých genomických řešeních pro budoucnost. 🔮🔬
Nabsys - Specializuje se na elektronické detekční technologie pro genomiku. ⚡️🔬
Quantum-Si - Zaměřuje se na proteomiku a vyvíjí technologie pro sekvenování. 🧬🔬
SeqLL - Poskytuje služby sekvenování s využitím technologie True Single Molecule Sequencing (tSMS). 🔬🔍
GnuBIO - Vyvíjí mikrofluidní technologie pro sekvenování s důrazem na inovaci. 💧🔬
Halcyon Molecular - Pracuje na vývoji nových metod pro sekvenování DNA. 🧬🔬
Zymo Research - Nabízí řešení pro epigenetiku a sekvenování s důrazem na přesnost. 🧬🔍
🌟 Přehled poskytovatelů NGS služeb 🌟
Sekvenování nové generace (NGS) je klíčovou technologií, kterou využívají nejen laboratoře s vlastními přístroji, ale také mnoho firem, které nabízejí NGS jako službu. Zde je přehled některých významných poskytovatelů NGS služeb, který vám pomůže rozhodnout, zda je pro vás výhodnější investovat do vlastního zařízení nebo využít externí služby.
🔬 Hlavní poskytovatelé NGS služeb:
Illumina Services - Nabízí širokou škálu sekvenačních služeb s vysokou přesností a rychlostí. 🧬🔬
Thermo Fisher Scientific Services - Poskytuje služby s využitím technologie Ion Torrent, ideální pro rychlé a cenově efektivní sekvenování. ⚡️💵
PacBio Services - Zaměřuje se na dlouhá čtení a komplexní genomové analýzy. 📏🔍
Oxford Nanopore Services - Nabízí flexibilní a přenosné sekvenační služby s možností dlouhých čtení. 🚀🧬
BGI Genomics - Jeden z největších poskytovatelů NGS služeb na světě, známý pro svou cenovou dostupnost. 💹📈
Roche Sequencing Solutions - Poskytuje spolehlivé sekvenační služby pro různé aplikace. 🏛️🔬
Qiagen Services - Zaměřuje se na klinické aplikace s důrazem na přesnost a spolehlivost. 🏥🔍
Novogene - Nabízí širokou škálu sekvenačních služeb s využitím různých technologií. 🤝🔄
Macrogen - Poskytuje komplexní genomické služby, včetně NGS. 🌐🔬
Eurofins Genomics - Nabízí sekvenační služby s důrazem na kvalitu a rychlost. 🧬🔍
GATC Biotech (nyní součást Eurofins) - Známý pro své spolehlivé sekvenační služby. 🧬🔬
Genewiz (nyní součást Azenta Life Sciences) - Poskytuje širokou škálu genomických služeb. 🧬🔍
Personalis - Specializuje se na personalizovanou medicínu a genomické služby. 🧬❤️
Veritas Genetics - Nabízí služby celogenomového sekvenování pro klinické a výzkumné účely. 🌐🔬
GeneDx - Zaměřuje se na klinické sekvenační služby s důrazem na genetické testování. 🏥🔬
Ambry Genetics - Poskytuje genetické testování a sekvenační služby pro klinické aplikace. 🧬🔍
Blueprint Genetics - Nabízí klinické sekvenační služby s důrazem na přesnost a kvalitu. 🏥🔬
Invitae - Poskytuje genetické testování a sekvenační služby pro široké spektrum aplikací. 🧬🔍
Myriad Genetics - Známý pro své genetické testování a sekvenační služby. 🧬🔬
Centogene - Specializuje se na genetické testování a sekvenační služby pro vzácné nemoci. 🧬🔍
Fulgent Genetics - Nabízí širokou škálu genetických testů a sekvenačních služeb. 🧬🔬
Color Genomics - Poskytuje genetické testování a sekvenační služby pro zdravotní účely. 🧬🔍
Helix - Zaměřuje se na personalizovanou medicínu a genomické služby. 🧬❤️
Guardant Health - Specializuje se na sekvenační služby pro onkologii. 🧬🔬
Foundation Medicine - Poskytuje genomické služby pro onkologické aplikace. 🧬🔍
Caris Life Sciences - Nabízí sekvenační služby pro personalizovanou medicínu. 🧬❤️
Tempus - Zaměřuje se na genomické služby pro klinické aplikace. 🏥🔬
Sema4 - Poskytuje širokou škálu genomických služeb s důrazem na klinické aplikace. 🧬🔍
🏢 Kdy se vyplatí mít vlastní stroj vs. využít služby?
Vlastní stroj:
Výhody: Kontrola nad procesem, rychlá dostupnost výsledků, dlouhodobé úspory při vysokém objemu sekvenování.
Nevýhody: Vysoké počáteční náklady na zařízení, reagencie a zaměstnance, potřeba odborného personálu.
Využití služeb:
Výhody: Nižší počáteční náklady, přístup k nejnovějším technologiím bez nutnosti investic, vhodné pro menší objemy sekvenování.
Nevýhody: Závislost na externích dodavatelích, možné delší dodací lhůty.
Rozhodnutí: Investice do vlastního stroje se vyplatí při vysokém a pravidelném objemu sekvenování, kdy se náklady na zařízení a provoz začnou vyplácet. Pro menší laboratoře nebo projekty s nižší frekvencí sekvenování je často výhodnější využít externí služby. 🚀🔬
#Genomika #Sekvenování #NGS #Biotechnologie #Výzkum #Investice
Příklad návratnosti financí při pořízení NGS sekvenátoru:
Počet vzorků potřebných pro návratnost:
XXAsekvenátor za 16 000 000Kč: 16 000 vzorků
XXY sekvenátor za 36 000 000Kč : 36 000 vzorků
Čistý zisk na jeden vzorek: 1 000 Kč
Scénáře:
XXA sekvenátor:
Pokud zpracováváte 10 vzorků denně:
16 000 vzorků / 10 vzorků denně = 1 600 dní
Přibližně 4,4 roku
Pokud zpracováváte 50 vzorků denně:
16 000 vzorků / 50 vzorků denně = 320 dní
Přibližně 0,9 roku
XXY sekvenátor:
Pokud zpracováváte 10 vzorků denně:
36 000 vzorků / 10 vzorků denně = 3 600 dní
Přibližně 9,9 roku
Pokud zpracováváte 50 vzorků denně:
36 000 vzorků / 50 vzorků denně = 720 dní
Přibližně 2 roky
Závěr:
Doba návratnosti investice závisí na počtu vzorků, které zpracováváte denně. Při vyšším objemu zpracovaných vzorků se investice vrátí rychleji. Je důležité také zvážit další faktory, jako jsou změny v poptávce, provozní náklady a případné zvýšení ceny za analýzu vzorků.
