Biogen Praha uvádí nový nástroj pro analýzu NGS dat: Ultime+++.
Je navržen pro klinická pracoviště, výzkumné týmy i biotech firmy, které hledají rychlý, transparentní a přizpůsobitelný systém bez závislosti na uzavřených licencích.
🔬 Co Ultime+++ umí:
-
Analýza FASTQ → VCF → anotace včetně ACMG klasifikace
-
Automatické výstupy do Word, PDF, Excel, FHIR JSON
-
REST API, lokalizace, Docker, audit trail
-
Exporty pro publikace i klinická rozhodnutí
⚙️ Kompatibilita a výkon:
-
Funguje s daty z Illumina, Oxford Nanopore, PacBio, MGI
-
GPU akcelerace (Parabricks) i fallback na CPU
-
Validace variant, paralelizace, testovací framework
🚀 Srovnání: Ultime+++ vs. komerční nástroje
| Funkce / Platforma | Ultime+++ | DRAGEN | Genovesa | Galaxy |
|---|---|---|---|---|
| Otevřený kód | ✅ Ano | ❌ Ne | ❌ Ne | ✅ Ano |
| Exporty Word/PDF/JSON | ✅ Vše | ❌ Omezené | ✅ | ⚠️ Omezené |
| GPU podpora | ✅ Parabricks | ✅ Silná | ⚠️ Omezená | ⚠️ Omezená |
| Web rozhraní + API | ✅ | ❌ | ✅ | ✅ |
| Licence | ✅ Open / low | ❌ Vysoká | ❌ Vysoká | ✅ Open |
🔐 Pracujeme na:
-
Certifikacích: FDA, CLIA, ISO 15189
-
Autentifikaci (OAuth2), šifrování, zálohách
-
Rozšíření ACMG logiky + integraci s VEP
🧪 Chcete testovat Ultime+++?
Máte-li zájem o testovací sadu, sandbox nebo dockerový balíček:
📩 biogen@biogen.cz nebo rovnou kontaktujte nás zde.
Biogen Praha – tvoříme budoucnost bioinformatiky, která je rychlá, otevřená a lidská.