Využijte naše služby přímého sekvenování kolonií, které využívají amplifikaci pomocí válcové kruhové amplifikace (RCA) pro Sanger sekvenování bakteriálních klonů nebo fágových šablon bez nutnosti přípravy plasmidů. RCA generuje DNA pro sekvenování náhodným hexamerovým primováním kruhových šablon. Protokoly GENEWIZ RCA zvládnou sekvenační projekty jakékoliv velikosti a jsou optimalizovány pro produkci vysoce kvalitních čtení jak z bakteriálních kolonií, tak z glycerolových zásob, stejně jako z fágových plaků a supernatantů. Přímé sekvenování kolonií je také mimořádně efektivní, když je k dispozici malé množství výchozího materiálu DNA (např. nízkokopiové plasmidy).

 

Co je sekvenování kolonií?

Sekvenování kolonií je metoda, při které je plasmidová DNA (pDNA) extrahována a amplifikována přímo z mikrobiálních kolonií, což umožňuje produkci sekvenačních dat bez potřeby purifikace plasmidů. Kromě úspory času eliminací kroků přípravy plasmidů je dalším klíčovým přínosem sekvenování kolonií jeho flexibilita s výchozím vzorkem. Jakýkoliv velikost plasmidu, s vysokou nebo nízkou kopií plasmidové šablony, může být sekvenován přímým sekvenováním kolonií. Přímé sekvenování kolonií se běžně používá pro screening komplementárních DNA (cDNA) knihoven a mutagenezi řízenou místem.

NOVÉ Plasmid-EZ Čárové kódy

RCA Sekvenační data do 24 hodin

Použití RCA pro amplifikaci DNA urychluje proces Sanger sekvenování a umožňuje doručení vašich dat již za 24 hodin od přijetí vzorku v Azenta.

Sekvenování pomocí válcové kruhové amplifikace

 

RCA byla identifikována v přírodních systémech jako mechanismus replikace DNA často používaný při propagaci plasmidů a virů. Když jsou náhodné hexamery spojeny s DNA polymerázou s posunem vlákna, je generováno mnoho zřetězených kopií šablony bez potřeby termocyklení (Dean et al., 2001). Syntetizovaná vlákna jsou po jednom kole RCA vytlačena a jsou volná pro další kola vazby primerů. Exponenciální amplifikace je dosažitelná, pokud RCA reakce obsahuje primery komplementární k oběma vláknům šablony.

 

Vlastnosti a výhody přímého sekvenování kolonií

  • Úspora času a nákladů: není potřeba kultivovat kulturu a připravovat DNA
  • Vysoce kvalitní data: >600 bází Phred20 čtení
  • Návrh projektu a konzultace: vysoce kvalifikovaný tým specialistů na Sanger sekvenování je k dispozici po celou dobu projektu
  • Rychlé dodání: obdržíte svá Sanger data již za 24 hodin od přijetí vzorku v Azenta
  • Online objednávání: 24/7 online objednávkový a datový systém
  • Univerzální primery GENEWIZ: vyberte si z široké nabídky primerů dostupných bez dalších nákladů

 

Aplikace RCA sekvenování

  • Klonování shRNA a screening knihoven; Eliminujte přípravy plasmidů a sekvenujte kolonie přímo.
  • Analýza metylace DNA: Ušetřete čas a získejte vysoce kvalitní čtení klonováním PCR produktů přímo a sekvenováním bakteriálních kolonií.

Z

ískejte odměnu za své doporučení

Získejte 20% slevu na vaši další genomickou objednávku*

*Platí podmínky a ustanovení

 

MOŽNOSTI ODESLÁNÍ VZORKŮ

  •  
  • Glycerolová zásoba: Odešlete 96-jamkové destičky; vzorky musí být odeslány na suchém ledu. Označte typ média.
  • Bakteriální kolonie: Uspořádejte kolonie do mřížky na agarové destičce a zakroužkujte kolonie vyžadující sekvenování. Číselně označte každou kolonii. Neoznačené destičky budou zpracovány jako náhodný výběr. Pokud používáte tekutou kulturu, odevzdejte vzorky v 96-jamkové agarové destičce s páskovými uzávěry. Zabalte agarové destičky do parafilmu a poskytněte polštářek k ochraně před možným poškozením.

 

*Upozorňujeme: Protokol RCA je určen pro kruhové šablony <10 kb; lineární šablony nebudou dostatečně amplifikovány pro přímé Sanger sekvenování. Delší kruhové šablony nebo kruhové šablony nesené v bakteriálních kmenech s funkčním endA nemusí být spolehlivě amplifikovány, což přispívá k variabilním výsledkům.

 

Navštivte naše Pokyny pro odeslání vzorků pro další podrobnosti o bakteriálních šablonách. Objednejte si naše služby u Biogenu a zažijte bezkonkurenční kvalitu a pohodlí!

ANCHOR_TOP_TITLE

Tento web využívá cookies

Pro chod webu jsou nezbytně aktivovány esenciální soubory cookies. Pro plnohodnotné poskytování služeb, personalizaci reklam a analýzu návštěvnosti jsou však nutné povolit i volitelné cookies. Kliknutím na následující tlačítko, je zapnete. Zobrazit podrobnosti

Nastavení cookies

Vaše soukromí je důležité. Můžete si vybrat z nastavení cookies níže. Zobrazit podrobnosti