1. Katalogová čísla
- RA-102: ProkaryotníRNA-Seq(Transkriptom)
- SP-201-1101: Konstrukce mRNA-Seqknihovny
- HS-102-1002: 91 PEsekvenování
- BA-101-1102: Standardní bioinformatická analýza
- BA-301-1102: Bioinformatickáanalýza na zakázku
Transkriptom je celkový soubor transkriptů, především mRNA a nekódující RNA, v jedné buňce nebo v populaci buněk za určitých podmínek. Na základě sekvenční technologie příští generace, RNA-Seq (Transkriptom) je schopné podávat objektivní informace o transkriptomu a může být použito v základním vědeckém výzkumu, lékařském výzkumu, farmakogenomice a výzkumu léčiv.
Stav vzorku | Integrovaná celková RNA, která byla ošetřena DNázou. Vyhněte se kontaminaci proteiny při izolaci RNA. |
Množství vzorku | Pro prokaryotní vzorky: celková RNA ≥ 5μg. |
Koncentrace vzorku | Pro prokaryotní vzorky: koncentrace ≥65ng/ul |
Čistota vzorku | OD260/280≥1,8; OD260/230 ≥ 1,8; RNA 23S:16S≥1; RIN ≥ 6,0 |
Strategie konstrukce knihovny |
Knihovna krátkých insertů: cca 200 bp krátké inserty |
Sekvenční strategie | 91 PE Sekvenování |
Obsah bioinformatické analýzy |
Standardní bioinformatická analýza s referencí (referenční geny, genomová sekvence a genová anotace by měly být poskytnuty)
Standardní bioinformatická analýza (de novo sestavení transkriptomu)
Bioinformatická analýza na zakázku Můžeme také provést analýzu na zakázku pro splnění požadavků konkrétních projektů. |
Ukazatel dokončení | Čistá výstupní data by neměla být menší, než je požadováno ve smlouvě. |
Doba zpracování | Standardní doba odezvy pro tento postup (viz výše) je 50 pracovních dní. |