Populace buněk v heterogenních vzorcích je zřídkakdy homogenní a synchronizovaná ve svých charakteristikách. Sekvenováním jednotlivých buněk zkoumáme informace o sekvenci jednotlivých buněk. A právě jednobuněčnou sekvenací pochopíme rozdíly a funkce jednotlivých buněk v kontextu mikroprostředí, ve kterém se nacházejí.

Sekvenováním jednobuněčné RNA odhalíme diverzitu transkriptomů. Touto metodou můžeme identifikovat vzácné rakovinné kmenové buňky, které jsou rezistentní vůči lékové terapii. Právě transkriptomová analýza s rozlišením jedné buňky byla až doteď omezená nízkou kapacitou, pracnou technikou a v neposlední řadě cenou. Avšak nedávné pokroky v technologiích založených na mikrokapičkách umožnily provedení transkriptomové analýzy u desítek tisíc jednotlivých buněk. 

Technologie sekvenování RNA

Využíváme nejnovější technologii pro sekvenování jednobuněčné RNA: systém 10 × Genomics® Chromium™ a Illumina® NovaSeq™ 6000. Máme také zavedené optimalizované pracovní postupy pro analýzu, a to včetně kryokonzervace před odesláním a odstranění mrtvých buněk po odeslání. Tím maximalizuje flexibilitu projektu, rychlost a přesnost dat.

1. Rozdělení buněk

Rozdělení buněk

Buňky a kuličky s čárovým kódem jsou izolovány v kapičkách oleje pomocí 10 × Genomics Chromium.

2. Příprava knihovny

Příprava knihovny
Během reverzní transkripce se inkorporují čárové kódy specifické pro buňky a transkripty.

3. Sekvenování

Sekvenování
Knihovny s čárovým kódem jsou spojeny a sekvenují se na platformě Illumina.

4. Analýza dat

Analýza dat
Vizualizace výsledků prostřednictvím interaktivního softwaru a vlastní analýza.

Vlastnosti a výhody GENEWIZ Single-Cell RNA-Seq:

  • První uživatel 10 × Genomics Chromium s optimalizovaným pracovním postupem, který maximalizuje flexibilitu projektu, rychlost a přesnost dat.
  • Sekvenční platformy s nejvyšší propustností, včetně Illumina NovaSeq 6000, poskytují cenově výhodné jednobuněčné analýzy.
  • Vzorky akceptované v různých fázích 10 × pracovního postupu – buňky, gelové kuličky v emulzi (GEM) a 10 × cDNA knihovny s čárovým kódem.
  • Odstranění mrtvých buněk zlepšuje kvalitu dat, zejména u projektů se suboptimálními vzorky.
  • Patentovaný protokol zmrazení buněk udržuje životaschopnost buněk během přepravy a poskytuje pohodlnou přepravu vzorků.
  • Interaktivní zpráva o analýze poskytuje intuitivní způsob, jak prozkoumat data a najít biologické souvislosti.
ANCHOR_TOP_TITLE

Tento web využívá cookies

Pro chod webu jsou nezbytně aktivovány esenciální soubory cookies. Pro plnohodnotné poskytování služeb, personalizaci reklam a analýzu návštěvnosti jsou však nutné povolit i volitelné cookies. Kliknutím na následující tlačítko, je zapnete. Zobrazit podrobnosti

Nastavení cookies

Vaše soukromí je důležité. Můžete si vybrat z nastavení cookies níže. Zobrazit podrobnosti