Sekvenování RNA s ultra nízkým vstupním množstvím je technologie, která poskytuje vysokokapacitní analýzu exprese vzorků obsahující pouhých 10 pg RNA nebo jen několik buněk. Tuto metodu doporučujeme aplikovat po fluorescenčně aktivovaném třídění buněk (FACS) nebo po imunoprecipitaci (RIP-Seq).
Správná charakterizace transkriptomu do značné míry závisí na kvalitě a množství vstupní RNA. Standardní přístupy RNA-Seq vyžadují dostatečné množství intaktní RNA, tedy větší než 500 ng. Nicméně pokud máte vzorky s nižšími výtěžky a degradovanou RNA, je nutné přistoupit k dalším amplifikačním procesům a vyšší hloubce sekvenování. Tím sice získáte vyšší množství výstupních dat, avšak tyto vzorky jsou náchylné ke zkreslování transkripce a špatnému mapování čtení na exony.
