Cílené sekvenování, neboli hotspot sekvenování, je velmi efektivní a citlivá analýza pro potřeby precizní onkologie. V rámci tohoto přístupu je jasně a přesně definovaný panel genů, které jsou významné v nádorové biologii (několik desítek až sto genů). Tento panel genů je dále vyšetřený metodou sekvenování nové generace.
Zaměření na konkrétní skupinu genů poskytuje větší hloubku čtení a tím pádem i vysokou citlivost, což může mít svůj význam především u nádorových biopsií s nízkým zastoupením nádorových buněk. S genovými panely cíleného sekvenování můžete objevit také další změny, jako jsou bodové mutace, inzerce/delece (INDEL), varianty počtu kopií (CNV) a přestavby genů.